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El Centro Básico, nombre original de nuestro centro, surgió desde el nacimiento de la Universidad Autónoma de Aguascalientes, y fue en este origen diseñado para agrupar las disciplinas relacionadas con las Ciencias Sociales y Naturales, lo anterior se mantuvo hasta el año de 1977, en el cual la universidad tuvo una reestructuración muy importante. Para este año se creyó conveniente que solamente las ciencias naturales pertenecieran a este centro. A partir de este rediseño, el Centro Básico ha sido el encargado de manejar la docencia, investigación y extensión de las disciplinas relacionadas a las Ciencias Físicas y Naturales.

En un principio estaba formado únicamente por cuatro departamentos: Biología, Química, Física y Matemáticas, así como Ciencias Sociales, pero sin ninguna carrera adscrita al mismo, únicamente se impartía apoyo docente a las carreras que en su plan de estudios requerían de alguna materia relacionada. La primera carrera con que contó nuestro centro fue Sociología, pero con la reestructuración ya mencionada en el año de 1977, y a raíz de la puesta en marcha del primer Plan de Desarrollo, las disciplinas sociales pasaron al recién creado Centro de Artes y Humanidades y, con ellas, la carrera de Sociología pasó a pertenecer a este último; pero al mismo tiempo, se adjudicaron al Centro Básico otros departamentos que en un principio estaban asignados al Centro Biomédico.

A partir de estas modificaciones, el Centro ya se integraba por los siguientes departamentos: Morfología, Física y Matemáticas, Biología, Micro-Biología, Bioquímica y Fisiología, así como Farmacología. Tambien la carrera de Biología, adscrita en un principio al Centro Biomédico, se incorporó al Centro Básico en la restructuración debido a que el mayor porcentaje de materias de la currícula de esta carrera se encontraban adscritas al Centro Básico.


Posteriormente se agregaron el Departamento de Informática, con las carreras de Ingeniería en Sistemas Computacionales (1982) y Licenciatura en Informática (1986), el cual debido a su crecimiento se dividió en dos ocasiones, la primera en Sistemas de Información y en Sistemas Electrónicos, y la segunda, este último nuevamente se dividió en Sistemas Electrónicos y Ciencias de la Computación, la cual aportó la carrera de Ingeniería en Computación Inteligente.

Actualmente se llama Centro de Ciencias Básicas, cuenta con 11 PE de pregrado, el 100% de ellos con reconocimiento nacional al contar con el Nivel 1 de CIEES o estar reconocidos por el COPAES, a la fecha sólo el PE de Ing en Electrónica cuenta con reconocimiento internacional por ABET. Además es un centro líder en investigación y posgrado pues cuenta con seis PE de posgrado, cinco con reconocimiento en el PNPC del CONACyT y el otro está por someterse a evaluación por ser de reciente creación (aprobado por el Honorable Consejo Universitario en Junio de 2017); cuatro de estos programas de posgrado tienen reconocimiento internacional por la AUIP. Además, el centro cuenta con 14 cuerpos académicos: 2 en formación, 5 en consolidación y 7 consolidados.

Además de todo lo anterior, el centro apoya con las materias básicas a casi la totalidad de los PE de la Universidad Autónoma de Aguascalientes.

La Misión del Centro de Ciencias Básicas consiste en buscar la verdad por medio de la investigación científica y en transmitir el conocimiento de las disciplinas que en él se cultivan mediante la enseñanza y la difusión, contribuyendo con ello al desarrollo integral de Aguascalientes y de México.

Para el cumplimiento de esta misión se deberán tomar en cuenta los siguientes elementos:

El Centro deberá mantenerse en comunicación con su comunidad e intervendrá de manera positiva en su vida; la docencia, investigación y difusión se planearán de tal suerte que contribuyan al desarrollo integral de la región.

Se buscará que los estudiantes de este Centro comprendan los alcances y limitaciones de la ciencia como base del desarrollo moderno, que sean maduros y adopten actitudes de servicio y compromiso en lo que se refiere a su participación en la vida comunitaria, para que se constituyan como los profesionales que el estado y el país requieren para la realización del bien común.